- 办公室（宣传教育科）
- 督察科
- 综合科（包头市生态环境保护委员会办公室秘书科）
- 科技科
- 法规与标准科
- 人事科
- 财务与项目管理科
- 自然生态保护科
- 水生态环境科
- 大气环境科
- 应对气候变化科
- 土壤生态环境科
- 固体废物与化学品科
- 核与辐射安全监管科
- 行政审批科
- 生态环境监测科
- 生态环境应急与信访科
- 机关党委（精神文明建设办公室）
固体废物与化学品科
负责人：郭启峰 联系电话：0472-5191108
负责全市固体废物、化学品、重金属等污染防治的监督管理，组织实施危险废物经营许可和跨地区转移审批。落实新化学物质环境管理登记、废弃电器电子产品处理等环境管理制度。
