办公室（宣传教育科）
督察科
综合科（包头市生态环境保护委员会办公室秘书科）
法规与标准科
人事科
财务与项目管理科
自然生态保护科
水生态环境科
大气环境科
应对气候变化科
土壤生态环境科
固体废物与化学品科
核与辐射安全监管科
行政审批科
生态环境监测科
生态环境应急与信访科
科技科
机关党委（精神文明建设办公室）
人事科
负责人：张琬晨 联系电话：0472-5191111
承担机关、派出机构及所属单位的干部人事、机构编制、劳动工资、教育培训工作，指导生态环境行业人才队伍建设工作，承担生态环境保护系统领导干部双重管理有关工作，承担全市生态环境行政体制改革有关工作。