办公室（宣传教育科）
督察科
综合科（包头市生态环境保护委员会办公室秘书科）
法规与标准科
人事科
财务与项目管理科
自然生态保护科
水生态环境科
大气环境科
应对气候变化科
土壤生态环境科
固体废物与化学品科
核与辐射安全监管科
行政审批科
生态环境监测科
生态环境应急与信访科
科技科
机关党委（精神文明建设办公室）
综合科（包头市生态环境保护委员会办公室秘书科）
负责人：李莉丽 联系电话：0472-5191209
组织起草生态环境政策、规划，协调和审核生态环境专项规划，组织开展生态环境统计、污染源普查和生态环境形势分析工作，承担全市污染物排放总量控制综合协调和管理工作，拟订包头市生态环境保护年度目标考核计划。承担生态文明体制改革相关工作。承担包头市生态环境保护委员会办公室日常工作。